本次的故事发生在全新的冒险舞台——“合众地方”。其蓝本是第五世代游戏（口袋妖怪黑白）。小智与皮卡丘和新伙伴艾莉丝、天桐一起展开为了追寻梦想和冒险以及和各种各样神奇宝贝的邂逅的旅行。。冒险达人埃德·斯塔福德这次选择和妻子劳拉、2岁的儿子蓝恩一起冒险，他们将在印度尼西亚的一个荒岛上共度一个月，以寻求更健康的家庭生活。。
